植物的不可移动性需要植物进化出一套成熟的机制，通过对转录输出进行精确的调控来对各种环境信号进行综合的应答。而转录过程中，RNA聚合酶II是参与合成编码蛋白的mRNA的关键酶。通过与各种不同辅助蛋白因子的结合，RNA聚合酶II的转录行为在一系列转录步骤中（转录起始、延伸和终止）被动态调节着。在这些连续的过程中，越来越多证据表明RNA聚合酶II在延伸阶段早期的停滞（或转录起始向转录延伸的转换）是真核生物中一种普遍存在的调控方式。那么在植物中，这种转录起始向延伸的转换调节是否存在以及如何调控呢？在不断变化的环境中，植物转录的精确调控是如何在各种辅助蛋白因子的辅助下维持的呢？围绕以上这些问题，我们的研究将从一下几个角度展开：
1.解构转录起始和延伸阶段，转录复合体的不同组分并由此解析阶段转换间的分子机制。
2.阐明转录以及与转录过程相偶联的分子事件（包括DNA甲基化、组蛋白修饰以及RNA处理）之间的相互调控机理 。
3.转录包括转录复合体以及与转录相偶联的分子事件对于多种胁迫过程的应答。
